Neuropædagogik bygger på neuropsykologi, som er læren om forholdet mellem hjerne og adfærd. I neuropædagogikken kortlægges barnets ressourcer og områder, hvor barnet har udfordringer. Fx områder som opmærksomhed, kommunikation, hukommelse, orienteringsevne, motorik og social funktion. Metoder indenfor neuropædagogikken skal vise, hvad barnet kan og ikke kan uden hjælp, og på den måde gøre det muligt at stille krav, der matcher barnets forudsætninger.